惠州慈云图书馆系国家地级市一级图书馆、广东省古籍重点保护单位，也是文化信息资源共享工程惠州市支中心，2002年分别由惠州市人民政府、香港慈云阁董事局出资兴建新馆。
新馆于2004年9月30日落成投入使用，馆址座落于江北三新南路15号，是一座集藏书、借阅、信息咨询、文化研究、教育培训、文化休闲于一体的综合性多功能的现代化建筑。用地面积2万平方米，建筑面积1.926万平方米，高四层，地下架空一层，园林绿化面积约为1.48万平方米，地下架空层和室外停车场共设有120个停车位。馆体呈“丙”字形结构，面朝西北，正中楼顶有本翻开的书本造型，是惠州市区一座标志性建筑。
馆内的机构设置为办公室、图书借阅部、报刊借阅部、采编部、特藏部、读者活动综合服务部、数字阅读服务中心等7个部室及1个下属分馆——惠州少儿图书馆（副科级建制，于2008年7月落成使用）。馆内有19个功能厅，设1090个阅读座位，拥有一个容纳360个座位的学术报告厅和一个展览厅。目前馆内纸质藏书76万余册，在职员工61人。有较为完善的自动化计算机网络体系，实行自动化管理，建立了文化信息资源共享工程网络平台，门户网站（网址http://www.hzlib.cn）、微信公众号（惠州慈云图书馆）和新浪微博同步开通。惠州市数字图书馆于2015年建设完成，可以实现馆藏电子资源远程访问、单点登录、一站式跨库检索、远程文献传递、网上图书续借、读者证挂失、个人信息查询及修改等功能。2008年，我馆开始实施免费开放，免费项目达二十四项；2016年，我馆实施全市公共图书馆总分馆体系建设，初步实现全市各级公共图书馆的“通借通还”；2017年3月起，我馆开始实行免押金借阅，广大市民可通过第二代身份证免费借阅图书。此外，我馆作为公共阅读文化服务阵地，每年都会以阅读为主题，根据不同服务群体，大力开展形式多样、精彩纷呈的公益讲座和读者活动。
本馆每周开放时间达72小时，周一闭馆，周二至周日的开放时间为上午9时至晚上9时，法定节假日不休息。馆舍右侧设有一间24小时自助阅览室，提供图书的自助借、阅和归还服务。
